堀部 和也

堀部 和也

Specially Appointed Assistant Professor

大阪大学

Biography

堀部和也の個人ページです.
大阪大学 大学院基礎工学研究科 システム創生専攻  石黒浩研究室の特任助教です.

興味・関心

  • Neural networks
  • Morphogenesis
  • Pattern dynamics
  • Evolution
  • Artificial life
  • Urban planning theory

学歴

  • D.Sci. Biological Science, Supervisor:Koichi Fujimoto, 2021

    Osaka University

  • Complex Systems Summer School, 2019

    Santa Fe Institute

  • M.Eng. Information Scienece and Technology,Supervisor:Taro Maeda, 2018

    Osaka University

  • B.Sc. Biological Science,Supervisor:Koichi Fujimoto, 2016

    Osaka University

News

Schedule

2023

2022

~2021

Publications

(see also Google Citation and ResearchGate)

Journal papers (Refereed)

  1. Horibe, K., Walker, K., Palm, RB., Sudhakaran, S., and Risi, S. "Severe damage recovery in evolving soft robots through differentiable programming",
    Genetic Programming and Evolvable Machines, 1-22. (2022)
  2. Matsushita, K., Horibe, K., Kamamoto, N., & Fujimoto, K. "Cell Motion Alignment as a Polarity Memory Effect",
    Journal of the Physical Society of Japan, 88(10), 103801. (2019)
  3. Horibe, K., Hironaka, K., Matsushita, K., and Fujimoto, K., "Curved surface geometry-induced topological change of an excitable planar wavefront",
    Chaos: An Interdisciplinary Journalof Nonlinear Science, vol. 29, no. 9, p. 093 120, 2019 (2019)

International Conferences (Refereed)

  1. Horibe, K., Walker, K., & Risi, S. "Regenerating Soft Robots through Neural Cellular Automata",
    Genetic Programming: 24th European Conference, EuroGP 2021, Held as Part of EvoStar 2021, Virtual Event, April 7--9, 2021, Proceedings, p.36 (2021)
  2. Matsushita, K., Horibe, K., Kamamoto, N., & Fujimoto, K., “Cell migration driven byreceptor density polarity of cell-matrix adhesion”,
    Proceedings of the Symposium on Simulation ofTraffic Flow, vol. 24, pp. 5–8 (2018)

Presentations

International Conference (Oral)

  1. Horibe, K., Walker, K., & Risi, S. "Regenerating Soft Robots through Neural Cellular Automata",
    Genetic Programming: 24th European Conference, EuroGP 2021, Held as Part of EvoStar 2021, Virtual Event, April 7--9, 2021, Proceedings, p.36 (2021)
  2. K. Horibe,K. Hironaka,K. Matsushita,K. Fujimoto, "The surface geometry of cerebral cortex induces topological changes of cortical traveling waves",
    4th HBP Student Conference on Interdisciplinary Brain Research, Pisa. Italy. Jan. 2020

International Conference (Poster)

  1. K. Horibe,G. Taga,K. Fujimoto, "How are long-range association fibers developed?: Estimation of neural propagation by shortest paths on the cortical surface",
    EMBL Symposium: Mechanobiology in development and disease, Heidelberg. Germany. June. 2022
  2. K. Horibe,K. Hironaka,K. Matsushita,K. Fujimoto, "The surface geometry of living things induces a topological change of a chemical traveling wave during morphogenesis",
    EMBL-IBEC Winter Conference, Barcelona. Spain. Feb. 2020
  3. K. Horibe,K. Hironaka,K. Matsushita,K. Fujimoto, "The surface geometry of cerebral cortex induces topological changes of cortical traveling waves",
    4th HBP Student Conference on Interdisciplinary Brain Research, Pisa. Italy. Jan. 2020
  4. K. Horibe,K. Hironaka,K. Matsushita,K. Fujimoto, "Curvature-driven splitting of a planar travelling wave",
    Patterns and Waves 2016 ,P-28, Hokkaido. Japan. Aug. 2016

国内会議 (招待講演)

  1. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "曲面上の生命現象を理解する:曲面による進行パルス波の分裂",
    第8回定量生物学の会,愛知,2017年1月

国内会議 (口頭発表)

  1. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "生物表面上での進行波による新奇な信号伝搬の様式:大脳皮質を題材として",
    京都大学数理解析研究所研究集会「第15回生物数学の理論とその応用」,京都,2018年9月
  2. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "生物の表面形状の機能を理解する:曲面による進行波の分裂",
    第83回形の科学シンポジウム「伝統の形と形の科学」,石川,2017年6月
  3. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "曲面による進行パルス波の分裂",
    日本物理学会大72回大会 ,19pB13-2,大阪,2017年3月
  4. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "曲面によって引き起こされる進行波の分裂",
    京都大学数理解析研究所研究集会「第13回生物数学の理論とその応用」 ,京都,2016年11月
  5. 堀部和也,北尾太嗣,古川正紘,安藤英由樹,前田太郎, "身体所有感領域の内外における物体の運動イメージの変容の検証",
    日本バーチャルリアリティ学会第21回大会 ,13B-04,茨城,2016年9月

国内会議 (ポスター)

     
  1. 堀部和也,阿部真人 "生態系動態を記述する大自由度力学系の疑似アトラクタ構造に基づいた分類に向けて",
    ネットワーク科学研究会2022 , 講演番号8,,2022年8月
  2.  
  3. 堀部和也,伴碧, 高橋英之, 石黒浩 "ストレンジアトラクタの時空間構造は観察者にナラティブを想像させるか?:エージェントの動きに対する印象評価による探索",
    第2回人工生命研究会 ,A4,オンライン,2021年12月
  4.  
  5. 堀部和也, "グラフオートマトン再考〜生物発生・生物進化,人工生命のモデルへ向けて〜",
    定量生物学の会第9回年会 ,P94,京都,2018年12月
  6. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "曲面の幾何による進行スポットのカオス散乱",
    基研研究会・iTHEMS研究会 2018 非平衡系の物理学-階層性と普遍性- ,P23,京都,2018年12月
  7. Kazuya Horibe,Ken-ichi Hironaka,Katsuyoshi Matsushita,Koichi Fujimoto, "Restriction of cerebral cortical surface size by geometry-induced splitting of traveling wave front",
    日本神経回路学会第28回大会 JNNS2018 ,P2-14, Okinawa. Japan. Oct. 2018
  8. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "Functions of living matter surfaces:Curvature-driven splitting of a traveling wave",
     研究会「理論と実験」,広島,2017年10月
  9. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "Functions of living matter surfaces:Curvature-driven splitting of a traveling wave",
      日本生物物理学会第55回大会,熊本,2017年9月
  10. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "曲面上の生命現象を理解する:曲面による進行パルス波の分裂",
    第8回定量生物学の会,愛知,2017年1月
  11. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一,   "曲面によって引き起こされる進行波の分裂",
    日本生物物理学会第54回大会,3Pos285,茨城,2016年11月
  12. 堀部和也,廣中謙一,松下勝義,藤本仰一, "Curvature-driven splitting of a planar travelling wave”,
    日本数理生物学会第26回大会,P-46,福岡,2016年9月
  13. 永田智大,米田涼平,堀部和也,石原加奈子,小手石泰康,平大輔,野尻正樹, "銅含有亜硝酸還元酵素と電子供与体間の酸化還元平衡と電子移動反応",
    日本生化学学会第87回大会,2P-193,2014年10月/li>

公開セミナー

  1. "Long association fibers emerge from minimizing connectivity on the geometry of the human fetal brain"
    Cognitive Neuroanatomy Lab, Labseiminar, Online,14th Jun. 2022
  2. "Surface geometry-induced splitting of traveling wave" 数理科学セミナー,北海道大学,2018年11月21日
  3. "How surface geometry controls neuronal signal propagation on cerebral cortex"
    Tani Lab. セミナー,OIST,2018年10月15日
  4. "チューリングの夢:生物の形づくりの数理"
    学生力学系の会,京都大学,2018年10月13日
  5. "グラフオートマトンの上手な育て方はあるか?"
    第36回 全脳アーキテクチャ若手の会 カジュアルトーク 知能に関してカジュアルにトーク,Φカフェ,2018年6月27日
  6. "ニューラルネットワークとヘブ学習則のみを用いた脳機能のモデル化:連想記憶を例に考える"
    全脳アーキテクチャ若手の会 関西異分野交流会,Panasonic Wonder Lab,2017年10月28日
  7. "情報と形の相互作用による自己駆動システムとしての生命"
    Iwasaki Lab. セミナー,早稲田大学,2017年4月5日.

シンポジウムオーガナイズ

  1. "数理生物学の生命観",
    日本数理生物学会第29回大会,東京,2019年09月15日

Arts

Tachihokoru

  • WRO 2019 BIENNALE, ヴロツワフ, ポーランド, 2019

  • Art Hack Day, 東京, 日本, 2018

Work&Teaching

Work Experience

  • June 1, 2020 - December 31, 2020
    CrossLabs, Kyoto, Japan, Topic: Neural Centralization

  • October 1, 2019 - April 30, 2020
    IT University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark, Topic: Regenerating soft robots

  • November 1, 2017 - March 10, 2018
    noizarchitects, Tokyo, Japan, Topic: Urban planning theory

  • March 15, 2017 - April 8, 2017
    noizarchitects, Tokyo, Japan, Topic: Automatic drawing, Computational design

Teaching

  • April 9, 2019 - Jun, 2019
    情報科学基礎, TA, Osaka Uni.
  • April 9, 2019 - August, 2019
    現代生命科学の基礎, TA, Osaka Uni.
  • December 13, 2018 - December 14, 2018
    生物学実験, TA, Osaka Uni.
  • April 9, 2018 - Augusut 8, 2018
    現代生命科学の基礎, TA, Osaka Uni.
  • September 25, 2017 - September 30, 2017
    Marine Biology Field Work (Shirahama), Chemistry - Biology Combined Major Program, TA, Osaka Uni.

Awards

Award

Science
  • April, 2014
    澤田明,堀部和也,神経活動による寿命の決定,平成25年後期大阪大学理学部オナーセミナー自主研究発表会・ベストパフォーマンス賞

  • November, 2013
    堀部和也,高度好熱菌由来銅含有タンパクの構造と機能,平成25年前期大阪大学理学部オナーセミナー自主研究発表会・ベストパフォーマンス賞

Art

Grant

Crowdfunding